Genetisk informasjonen kan hjelpe oss å forstå Livsstil risiko for sykdom

Genetic Information Might Help Us Understand Lifestyle Risks for Disease

Genetiske varianter forutsi biologisk risiko for sykdom, men de kan også være i stand til å fortelle oss om arveatferdsrisikofaktorer


Powered by Guardian.co.ukDenne artikkel med tittelen “Genetisk informasjon kan hjelpe oss å forstå livsstil risiko for sykdom” ble skrevet av Suzi Gage, for theguardian.com mandag 22 februar 2016 13.16 UTC

Når du leser artikler som hevder at det er en rekke gener som spår en sykdom, vanligvis denne informasjonen kommer fra genom-wide assosiasjonsstudier (GWAS). Disse hypotese frie analyser bruke et stort antall mennesker, og se etter sammenhenger mellom en sykdom og genetiske variasjoner i mange hundretusener av steder over hele genomet.

Men å vite at det finnes 108 genetiske steder forbundet med schizofreni er ikke nødvendigvis så nyttig hvis du ikke vet hva disse genetiske varianter faktisk gjøre. GWAS er et forskningsverktøy, en måte å hjelpe oss å forstå en sykdom. Noen ganger er det kjent at en variant koder for et protein, og deretter funksjonen av genet som er lettere å forstå, men i det øyeblikket den biologiske funksjonen til en rekke genetiske varianter er bare ikke kjent, begrense bruken av GWAS som et analyseverktøy.

Det har vært antatt at genetiske varianter som er identifisert av GWAS representerer direkte, biologiske risikofaktorer for sykdom - i "natur" i stedet for "pleie" slutten av risiko. Mine kolleger og jeg har nylig publiserte en artikkel der foreslår vi at det kan være mer informasjon enn det som finnes i resultatene.

Når en GWAS av lungekreft ble gjennomført, en genetisk variant som er sterkt assosiert med lungecancer var en kjent variant som ligger innenfor et område på kromosom 15 kalt "nikotin acetylkolin genet reseptor cluster". Denne varianten har vist seg å være knyttet til antallet røykte sigaretter per dag, i folk som røyker. Selv om det kan være tilfelle at genet også øker uavhengig risiko for lungekreft, samt tyngde av røyking, det virker langt mer sannsynlig at denne varianten er identifisert i GWAS for lungekreft fordi røyking fører til lungekreft.

Det er et annet godt eksempel på alkohol litteratur. En genetisk variant har blitt identifisert som spår alkoholforbruk. Det koder for et protein som bryter ned toksiske metabolitter av alkohol til ikke-toksiske seg. Hvis du ikke har mye av dette proteinet, nivåer av giftstoffer kan bygge opp, forårsaker du å føle seg syk og spyles. Varianten er ikke veldig vanlig i europeiske populasjoner, men er mer vanlig i populasjoner av østasiatisk opphav. I disse grupper, GWAS av høyt blodtrykk identifisert denne spesielle alkoholrelaterte genotype. Men det er ikke sett i GWAS av høyt blodtrykk i europeiske populasjoner. Dette er ganske sterke bevis på at alkohol forbruk kan bidra til høyt blodtrykk.

Disse funnene førte til en interessant tanke: kanskje, samt bekrefter årsaks assosiasjoner vi allerede vet (som røyking og lungekreft), det kan hjelpe oss å identifisere andre årsaksrisikofaktorer for sykdom. For eksempel, samme røyking varianten ble også identifisert i en fersk GWAS av schizofreni - kan dette bety at røyking er en kausal risikofaktor for sykdommen? Muligens, selv om videre testing vil være nødvendig for å bekrefte dette, som det fortsatt er mulig dette kan bli delt genetisk arkitektur.

For øyeblikket, den viktigste begrensningen i å tolke GWAS på denne måten er at det er ikke veldig mange genetiske prediktorer for modifiserbare risikofaktorer identifisert. Men dette er i endring. For eksempel, Vi vet at bruk av cannabis er i det minste delvis arvelig, tyder det er en genetisk komponent, men som ennå ingen varianter som er identifisert. Når disse variantene begynner å bli funnet, opplysningene i GWAS kan åpne opp for oss.

Og hvorfor er dette nyttig? Vel, det er mye lettere å hjelpe folk til å endre sine livsstil atferd enn det er å endre deres genetikk!

guardian.co.uk © Guardian News & Media Limited 2010